Biokemisk inkubator: Har et dobbelt-funktions temperaturkontrolsystem til både køling og opvarmning (typisk 0-60 grader); bruges til mikrobiel kultur, BOD-bestemmelse og lav-temperaturkonstant-temperaturtest. Nogle modeller understøtter grundlæggende fugtighedskontrol, selvom dette ikke er en kernefunktion.
Konstant-temperatur-inkubator: Har primært varmefunktioner (selvom nogle avancerede-modeller inkluderer køling); bruges til bakteriekultur, fermentering og rutinemæssig konstant-temperaturtestning; giver god tætningsevne.
Konstant-temperatur- og fugtighedsinkubator: Styrer præcist både temperatur og fugtighed (f.eks. 30 %-95 % relativ luftfugtighed); velegnet til testning af lægemiddelstabilitet, plantedyrkning og mikrobielle kulturer, der kræver miljøer med høj-fugtighed.
CO₂-inkubator: Designet specifikt til celle- og vævskultur; kontrollerer præcist temperatur, fugtighed og CO₂-koncentration (typisk 5%-20%) for at simulere in vivo-miljøer.
Mug-inkubator: Designet specielt til svampe; har temperaturkontrol og befugtningsfunktioner; velegnet til dyrkning i miljøer med høj-fugtighed ved temperaturer nær stuetemperatur.
Oplyst inkubator (kunstigt klimakammer): Integrerer lysstyring for at simulere døgnrytmer; primært brugt til planteavl, frøspiring og forskning i lys-følsomme mikroorganismer.
Anaerob inkubator: Giver et ilt-frit miljø (lavt-ilt eller nul-ilt); kombineret med et konstant-temperatursystem bruges det til isolering og dyrkning af strenge anaerober.